赤壁之战第六船队是游戏中的一个进阶挑战，共包含五个关卡，每一关又分为两场独立战斗，且部分场次会提供或面对特殊的战场器械，例如治疗帐篷、投石车或巨弩，这些器械的存在会显著影响战局的走向，因此通关的核心在于根据敌方阵容特点与我方可用的器械支持，进行极具针对性的阵容调整与布阵。玩家需要准确识别敌方阵容是侧重前排恢复、后排爆发，还是拥有强力的骑兵突击或召唤能力，并据此搭配能够形成克制的己方主将军师组合，整个过程要求玩家对兵种特性与主将技能有较深的理解，而非单纯依靠战力碾压。
针对第一关，首场战斗敌方为四盾将与四弓手组合，军师为周瑜，其特点是前排具备自我恢复能力而后排输出强力，应对时由于敌方没有治疗单位，可以优先考虑派遣重骑或轻骑从边路进行突破以直捣后排，同时军师选择张宝可直接晕眩敌方后排弓手，弓手位配置张郃利用其中毒效果削弱敌方前排的回血能力是有效的策略；第二场敌方变为四盾将与四步兵，军师荀彧使得队伍整体坦度极高，此时我方需要组建高输出阵容来突破，例如使用赵云与公孙瓒的搭配以获得破甲效果，配合黄盖、董卓等盾将稳固前排，再由孙尚香、甘宁等强力弓手在后排提供持续伤害。
进入第二关，首场将面对以六重骑两轻骑为主的敌军，其突破能力极强，对我方前排盾将威胁巨大，此场我方拥有治疗帐篷，布阵上应着重保护前排，可以考虑使用军师荀彧，其水遁技能能有效抵挡重骑的多次冲锋并提供治疗，同时后排应配置足够数量的弓手，如步练师、张郃等来快速削减敌方骑兵单位；次场敌方则拥有投石车，且阵容召唤能力较强，这时我方必须依赖重骑率先突破一路敌方前排，才能威胁到敌方后排的输出与器械，采用孟获、黄盖等盾将吸收伤害，并由太史慈、甘宁等弓手跟进输出的组合是可行的思路。
后续关卡的挑战在于应对更多变的敌人配置，例如第三关敌方可能拥有较强的轻骑单位对我方后排造成威胁，或是具备高额破甲与直线伤害能力，这要求我方布阵时前排需要放置不受轻骑影响或生存能力强的单位，后排则必须配置暴力输出的弓手队伍以求速战速决。当遇到能造成迟缓或沉默等减益效果的敌军时，我方两侧骑兵的突进作用就更为关键，需要他们承担更多的输出与干扰职责。在最终关卡，敌方可能拥有召唤能力或强大的整体硬度与恢复能力，此时我方需要确保阵容具备单点突破的能力，例如利用赵云跟随袁绍进行冲锋以削弱敌方前排，并且可能需要加入大乔等治疗型谋士来保证在持久战中的容错率。
关键在于灵活变阵，充分利用兵种克制关系，例如用重骑突击缺乏保护的后排，用高输出弓手集火突破厚实的盾将防线，并善用军师技能来创造优势或化解危机。对于战场器械的出现时机与效果要有预判，将其纳入整体战术考量。成功通过所有考验后，玩家将能获得丰厚的灵草等奖励，用于提升主将实力。
